Google AI解读185万濒危物种基因组

发生了什么？

Google发布了利用AI保存濒危物种遗传信息的项目。^{[Google Blog]}

核心是DeepVariant和DeepPolisher。DeepVariant是检测DNA变异的深度学习模型，DeepPolisher将基因组组装误差减少50%。^{[New Atlas]}

这些工具被投入Earth BioGenome Project（EBP）。目标是解读185万物种，目前已完成3,000种。^[EBP]

简单来说，就是在灭绝前创建基因备份。

我个人认为AI的作用是决定性的。测序成本已经大幅下降，但数据分析是瓶颈。AI正在解决这个瓶颈。

EBP的目标是到2026年完成1万物种。目前每周处理20种，但目标需要每周67种。^[Science]

UNEP-WCMC和Google已开始用AI分析野生动物贸易数据。^[UNEP-WCMC] 范围正从基因组保存扩展到非法贸易监控。

Q: 基因组保存能复活灭绝物种吗？

A: 理论上有这种可能性。如果遗传信息被保存，未来技术可以尝试复原。但目前技术还做不到。当前目标是记录现存物种的遗传多样性，用于保护策略。预防优于复原。

Q: DeepVariant如何工作？

A: 它将DNA测序数据转换成类似图像的格式，用深度学习进行分析。比传统统计方法的变异检测精度更高。2018年发布后，为完成首个完整人类基因组做出了贡献。它是开源的，任何研究人员都可以使用。

Q: 测序185万物种现实吗？

A: 这是个挑战。自2018年启动以来，已完成3,000种。第二阶段目标是到2030年完成15万种，需要将每周处理量增加36倍。需要同时提高AI分析速度和便携式测序实验室等基础设施创新。

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