Google AI、絶滅危惧種185万種のゲノムを解読

何が起きたのか？

GoogleがAIで絶滅危惧種の遺伝情報を保存するプロジェクトを発表した。^{[Google Blog]}

核心はDeepVariantとDeepPolisherだ。DeepVariantはDNA変異を検出するディープラーニングモデルで、DeepPolisherはゲノム組み立てエラーを50%削減する。^{[New Atlas]}

これらのツールはEarth BioGenome Project（EBP）に投入される。185万種の解読が目標で、現在3,000種を完了した。^[EBP]

簡単に言えば、絶滅前に遺伝子のバックアップを作ることだ。

個人的にはAIの役割が決定的だと考える。シーケンシングコストは急落したが、データ分析がボトルネックだった。AIがこのボトルネックを解消している。

EBPは2026年までに1万種が目標だ。現在は週20種だが、目標達成には週67種が必要だ。^[Science]

UNEP-WCMCとGoogleがAIで野生動物取引データの分析を開始した。^[UNEP-WCMC] ゲノム保存から違法取引監視まで範囲が広がっている。

Q: ゲノム保存で絶滅種を復活させられるか？

A: 理論的には可能性が開かれている。遺伝情報が保存されれば、将来の技術で復元を試みることができる。しかし現在の技術では難しい。今の目標は生存種の遺伝的多様性を記録し、保全戦略に活用することだ。復元より予防が優先だ。

Q: DeepVariantはどう動くのか？

A: DNAシーケンシングデータを画像のように変換し、ディープラーニングで分析する。従来の統計ベースの方法より変異検出精度が高い。2018年公開後、初の完全なヒトゲノム完成に貢献した。オープンソースで公開されているため、誰でも使用できる。

Q: 185万種のシーケンシングは現実的か？

A: 挑戦的だ。2018年開始以降、3,000種を完了した。2030年までに15万種が第2段階目標だが、週当たり処理量を36倍に増やす必要がある。AIの分析速度向上と携帯型シーケンシングラボのようなインフラ革新が同時に必要だ。

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